Észtországban közel 15 000 rovarfajt és több, mint 3500 egyéb gerinctelen fajt írtak le. A legtöbb gerinctelen faj a Balti-tengerhez és az édesvizekhez kapcsolódik.

A kelet- és közép-európai növényföldrajzi provinciák határa Észtországon húzódik keresztül, így a növényzet 538 edényes faja és alfaja, vagyis a taxonok 35%-a itt éri el elterjerjedése északi, északkeleti vagy keleti illetve nyugati, délnyugati vagy déli határát.

Észtországot északról és nyugatról a Balti-tenger és annak részei - a Finn-öböl és a Rigai (Lív)-öböl határolja. Az ország felségvizeinek szélessége 12 tengeri mérföld, azaz kb. 22,2 km.

Észtország az óceáni és a kontinentális éghajlatok átmeneti területein található. Éghajlatát elsősorban az Atlanti-óceán  - és az Észak-atlanti-ármalat - közelsége, illetve az óceán északi területei fölött zajló intenzív ciklonális tevékenység (Izlandi minimum) befolyásolja.

Észtország kis ország: területe közel azonos (45 227 km²), de lakosságának száma alig tizede (1999.01.01-én 1 445 580 fő) Hollandiáénak.